Abordagem computacional - Edian F. Franco

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Résumé :
Os genes Housekeeping (HKG) ou genes de refer?ncia s?o necess?rios para a manuten??o das fun??es celulares basais, as quais s?o essenciais para a sobreviv?ncias das c?lulas. Os m?todos de aprendizado de m?quinas s?o aplicados em diferentes ?reas dentro da gen?tica e gen?mica, permitindo a interpreta??o de grandes conjuntos de dados, como aqueles relacionados ? express?o g?nica. Uma das t?cnicas mais usadas s?o os algoritmos de agrupamento, t?cnica que permite definir grupos de genes com perfis de express?o similares, o que possibilita o estudo quanto ? fun??o e ? intera??o dos genes. A corynebacterium pseudotuberculosis, um pat?geno intracelular facultativo, que infecta principalmente ovelhas, cabras, equinos, entre outros ocasionando a doen?a linfadenite caseosa. Neste trabalho, ? apresentada uma nova metodologia para a identifica??o de genes Housekeeping in-silico atrav?s de t?cnicas de aprendizado de m?quina e dados de express?o genica de RNA-seq. Para a aplica??o desta nova abordagem, foram utilizadas t?cnicas n?o supervisionadas de agrupamentose m?tricas estat?sticas de avalia??o e dist?ncia para o processamento e an?lises dos dados gen?micos.

Biographie:
Doutorando em Biotecnologia pela Universidade Federal do Para (UFPa). Mestre em ci?ncia da computa??o- UFPa (2017) e gradua??o em engenharia de Sistemas - Universidad del Instituto Cultural Dom?nico-Americano (2013). Trabalha com pesquisas em de t?cnicas de aprendizado de m?quina e aprendizado profundo aplicadas a dados gen?micos/transcript?micos e an?lises de genomas. Atualmente realiza pesquisas no Laborat?rio de Engenharia-UFPa e professor no Instituto Tecnol?gico de Santo Domingo.?

Sommaire:
Os genes Housekeeping (HKG) ou genes de refer?ncia s?o necess?rios para a manuten??o das fun??es celulares basais, as quais s?o essenciais para a sobreviv?ncias das c?lulas. Os m?todos de aprendizado de m?quinas s?o aplicados em diferentes ?reas dentro da gen?tica e gen?mica, permitindo a interpreta??o de grandes conjuntos de dados, como aqueles relacionados ? express?o g?nica. Uma das t?cnicas mais usadas s?o os algoritmos de agrupamento, t?cnica que permite definir grupos de genes com perfis de express?o similares, o que possibilita o estudo quanto ? fun??o e ? intera??o dos genes. A corynebacterium pseudotuberculosis, um pat?geno intracelular facultativo, que infecta principalmente ovelhas, cabras, equinos, entre outros ocasionando a doen?a linfadenite caseosa. Neste trabalho, ? apresentada uma nova metodologia para a identifica??o de genes Housekeeping in-silico atrav?s de t?cnicas de aprendizado de m?quina e dados de express?o genica de RNA-seq. Para a aplica??o desta nova abordagem, foram utilizadas t?cnicas n?o supervisionadas de agrupamentose m?tricas estat?sticas de avalia??o e dist?ncia para o processamento e an?lises dos dados gen?micos....