Biological Sequence Analysis Using the SeqAn C++ Library - Gogol-Döring, Andreas
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Présentation Biological Sequence Analysis Using The Seqan C++ Library Format Broché
- Livre Informatique
Résumé : Written by SeqAn project founders, this book describes the general library design of SeqAn. It introduces biological sequence analysis problems, discusses the benefit of using software libraries, summarizes SeqAn design principles and goals, details SeqAn programming techniques, and demonstrates the application of these techniques in various examples. Focusing on SeqAn components, the second part explores basic functionality, sequence data structures, alignments, pattern and motif searching, string indices, and graphs. The last part describes applications of SeqAn to genome alignment, consensus sequence, suffix array construction.
Biographie: Co-founder of the SeqAn project, Andreas Gogol-D?ring works at the Max Delbr?ck Center for Molecular Medicine in Berlin, Germany. He was previously a research associate in the Algorithmic Bioinformatics group in the Department of Computer Science at Freie Universit?t Berlin in Germany. Co-founder of the SeqAn project, Knut Reinert is a professor and head of the Algorithmic Bioinformatics group in the Department of Computer Science at Freie Universit?t Berlin in Germany.
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