Molekulare Biogeographie - Thomas Schmitt

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Résumé :
Vorwort 11 1 Geschichte und Grundlagen der klassischen Biogeographie 15 1.1 Bioreiche und Faunenregionen 15 1.2 Ausbreitungszentren und Faunenelemente 17 2 Warum molekulare Biogeographie? 25 2.1 Selektion bei molekularen Markern 25 2.2 Die Masse macht's: Vorz?ge molekularer Marker f?r die Analyse einzelner Arten 26 2.3 Genealogien von molekularen Markern 27 2.4 Die Entstehung der Phylogeographie 27 3 Techniken der molekularen Biogeographie 29 3.1 Genetische Markersysteme 29 3.1.1 Allozyme 29 3.1.2 Mikrosatelliten 30 3.1.3 mtDNA Sequenzierung 31 3.1.4 Sequenzierung nukle?rer DANN 32 3.1.5 DNA-Fingerprinting-Techniken: RAPDs, AFLPs und verwandte Marker 33 3.1.6 Single Nucleotid Polymorphisms (SNPs) 35 3.2 Statistische Methoden der Auswertung molekularer Datens?tze 35 3.2.1 Genetische Diversit?ten und genetische Distanzen 35 3.2.2 F-Statistik 37 3.2.3 Haplotypennetzwerke 40 3.2.4 Mismatch Distributions und Tajima's D 42 3.2.5 Clusteranalysen 43 3.2.6 STRUCTURE, BAPS und GENELAND 45 3.2.7 Molekulare Uhren 45 4 Ausbreitung: Prozesse und Muster 49 5 Westliche Pal?arktis 55 5.1 Mediterrane Arten 55 5.1.1 Die mediterranen Refugialr?ume 55 5.1.2 Postglaziale Arealexpansionen aus mediterranen Refugialr?umen: Die vier Paradigmen 79 5.1.3 Ausbildung von Kontaktzonen in Europa 81 5.1.4 Die makrogenetische Struktur Europas f?r Arten mit mediterranen Ausbreitungszentren 84 5.1.5 Zusammenfassung mediterrane Arten 84 5.2 Kontinentale Arten 85 5.2.1 Extramediterrane Arealkerne und ihre Arealdynamiken 86 5.2.2 Kombination extramediterraner und mediterraner Arealkerne 98 5.2.3 Was macht extramediterrane Glazialrefugien so wichtig und so besonders? 105 5.2.4 Zusammenfassung kontinentale Arten 107 5.3 Gebirgsarten und Arten des Hohen Nordens 108 5.3.1 Genetische Strukturen innerhalb von Gebirgen 109 5.3.2 Biogeographische Verbindungen zwischen Gebirgssystemen 123 5.3.3 Arkto-alpine Arten 131 5.3.4 Boreo-montane und montan disjunkte Arten 136 5.3.5 Oro-mediterrane Arten 143 5.3.6 Zusammenfassung Gebirgsarten und Arten des Hohen Nordens 144 5.4 Arten der gro?en Flie?gew?sser Europas 145 5.4.1 Phylogeographie europ?ischer Fischarten 145 5.4.2 Zusammenfassung Arten der gro?en Flie?gew?sser 157 5.5 Zusammenfassung westliche Pal?arktis 157 6 Eurasien 159 6.1 Der Taigag?rtel Eurasiens 159 6.2 Biogeographische Verbindungen zwischen Ostasien und Nordamerika 169 6.3 Phylogeographie Ostasiens 172 6.3.1 Ost- und S?dchina 172 6.3.2 Tibet und die hohen Plateaus 180 6.3.3 Der trockene Westen Chinas 183 6.3.4 Japan 185 6.3.5 Taiwan 188 6.4 Phylogeographie S?dostasiens 190 6.4.1 Indien 195 6.4.2 Indochina 198 6.4.3 Sundaland 200 6.4.4 Philippinen 206 6.4.5 Wallacea 214 6.5 Zusammenfassung Eurasien 217 7 Nordamerika 221 7.1 Der S?dosten Nordamerikas 221 7.1.1 Beispiel Rattenschlange 222 7.1.2 Beispiel Klappschildkr?te 224 7.1.3 Biogeographische Paradigmen im s?d?stlichen Nordamerika 225 7.1.4 Refugien weiter n?rdlich in den ?stlichen USA 229 7.1.5 Biogeographie der K?stenbewohner des s?d?stlichen Nordamerikas 229 7.1.6 Mikrorefugien in den s?d?stlichen USA 232 7.2 Der Westen Nordamerikas 236 7.2.1 Von Norden und S?den: Die Bedeutung des Beringischen Refugiums f?r an K?lte angepasste Arten 236 7.2.2 Differenzierung in Beringien 238 7.2.3 Some like it cool: Kryptische Refugien im Nordwesten Nordamerikas 240 7.2.4 Refugien-in-Refugien: der Nordwesten der USA 244 7.2.5 Postglaziale Kolonisationsrouten im pazifischen Nordwesten Nordamerikas 248 7.2.6 Phylogeographische Ringe um das zentrale Tal Kaliforniens 249 7.2.7 S?dliche Regression, n?rdliche Expansion: R?ckzugsgebiete im S?dwesten Nordamerikas 253 7.2.8 Die W?sten Nordamerikas 257 7.2.9 Phylogeographischer Ring um das Gro?e Becken: die Ponderosa-Kiefer 262 7.3 Zusammenfassung Nordamerika 265 8 Subsahara-Afrika 267...

Biographie:
Vorwort 11 1 Geschichte und Grundlagen der klassischen Biogeographie 15 1.1 Bioreiche und Faunenregionen 15 1.2 Ausbreitungszentren und Faunenelemente 17 2 Warum molekulare Biogeographie? 25 2.1 Selektion bei molekularen Markern 25 2.2 Die Masse macht's: Vorz?ge molekularer Marker f?r die Analyse einzelner Arten 26 2.3 Genealogien von molekularen Markern 27 2.4 Die Entstehung der Phylogeographie 27 3 Techniken der molekularen Biogeographie 29 3.1 Genetische Markersysteme 29 3.1.1 Allozyme 29 3.1.2 Mikrosatelliten 30 3.1.3 mtDNA Sequenzierung 31 3.1.4 Sequenzierung nukle?rer DANN 32 3.1.5 DNA-Fingerprinting-Techniken: RAPDs, AFLPs und verwandte Marker 33 3.1.6 Single Nucleotid Polymorphisms (SNPs) 35 3.2 Statistische Methoden der Auswertung molekularer Datens?tze 35 3.2.1 Genetische Diversit?ten und genetische Distanzen 35 3.2.2 F-Statistik 37 3.2.3 Haplotypennetzwerke 40 3.2.4 Mismatch Distributions und Tajima's D 42 3.2.5 Clusteranalysen 43 3.2.6 STRUCTURE, BAPS und GENELAND 45 3.2.7 Molekulare Uhren 45 4 Ausbreitung: Prozesse und Muster 49 5 Westliche Pal?arktis 55 5.1 Mediterrane Arten 55 5.1.1 Die mediterranen Refugialr?ume 55 5.1.2 Postglaziale Arealexpansionen aus mediterranen Refugialr?umen: Die vier Paradigmen 79 5.1.3 Ausbildung von Kontaktzonen in Europa 81 5.1.4 Die makrogenetische Struktur Europas f?r Arten mit mediterranen Ausbreitungszentren 84 5.1.5 Zusammenfassung mediterrane Arten 84 5.2 Kontinentale Arten 85 5.2.1 Extramediterrane Arealkerne und ihre Arealdynamiken 86 5.2.2 Kombination extramediterraner und mediterraner Arealkerne 98 5.2.3 Was macht extramediterrane Glazialrefugien so wichtig und so besonders? 105 5.2.4 Zusammenfassung kontinentale Arten 107 5.3 Gebirgsarten und Arten des Hohen Nordens 108 5.3.1 Genetische Strukturen innerhalb von Gebirgen 109 5.3.2 Biogeographische Verbindungen zwischen Gebirgssystemen 123 5.3.3 Arkto-alpine Arten 131 5.3.4 Boreo-montane und montan disjunkte Arten 136 5.3.5 Oro-mediterrane Arten 143 5.3.6 Zusammenfassung Gebirgsarten und Arten des Hohen Nordens 144 5.4 Arten der gro?en Flie?gew?sser Europas 145 5.4.1 Phylogeographie europ?ischer Fischarten 145 5.4.2 Zusammenfassung Arten der gro?en Flie?gew?sser 157 5.5 Zusammenfassung westliche Pal?arktis 157 6 Eurasien 159 6.1 Der Taigag?rtel Eurasiens 159 6.2 Biogeographische Verbindungen zwischen Ostasien und Nordamerika 169 6.3 Phylogeographie Ostasiens 172 6.3.1 Ost- und S?dchina 172 6.3.2 Tibet und die hohen Plateaus 180 6.3.3 Der trockene Westen Chinas 183 6.3.4 Japan 185 6.3.5 Taiwan 188 6.4 Phylogeographie S?dostasiens 190 6.4.1 Indien 195 6.4.2 Indochina 198 6.4.3 Sundaland 200 6.4.4 Philippinen 206 6.4.5 Wallacea 214 6.5 Zusammenfassung Eurasien 217 7 Nordamerika 221 7.1 Der S?dosten Nordamerikas 221 7.1.1 Beispiel Rattenschlange 222 7.1.2 Beispiel Klappschildkr?te 224 7.1.3 Biogeographische Paradigmen im s?d?stlichen Nordamerika 225 7.1.4 Refugien weiter n?rdlich in den ?stlichen USA 229 7.1.5 Biogeographie der K?stenbewohner des s?d?stlichen Nordamerikas 229 7.1.6 Mikrorefugien in den s?d?stlichen USA 232 7.2 Der Westen Nordamerikas 236 7.2.1 Von Norden und S?den: Die Bedeutung des Beringischen Refugiums f?r an K?lte angepasste Arten 236 7.2.2 Differenzierung in Beringien 238 7.2.3 Some like it cool: Kryptische Refugien im Nordwesten Nordamerikas 240 7.2.4 Refugien-in-Refugien: der Nordwesten der USA 244 7.2.5 Postglaziale Kolonisationsrouten im pazifischen Nordwesten Nordamerikas 248 7.2.6 Phylogeographische Ringe um das zentrale Tal Kaliforniens 249 7.2.7 S?dliche Regression, n?rdliche Expansion: R?ckzugsgebiete im S?dwesten Nordamerikas 253 7.2.8 Die W?sten Nordamerikas 257 7.2.9 Phylogeographischer Ring um das Gro?e Becken: die Ponderosa-Kiefer 262 7.3 Zusammenfassung Nordamerika 265 8 Subsahara-Afrika 267...

Sommaire:
Vorwort 11 1 Geschichte und Grundlagen der klassischen Biogeographie 15 1.1 Bioreiche und Faunenregionen 15 1.2 Ausbreitungszentren und Faunenelemente 17 2 Warum molekulare Biogeographie? 25 2.1 Selektion bei molekularen Markern 25 2.2 Die Masse macht's: Vorz?ge molekularer Marker f?r die Analyse einzelner Arten 26 2.3 Genealogien von molekularen Markern 27 2.4 Die Entstehung der Phylogeographie 27 3 Techniken der molekularen Biogeographie 29 3.1 Genetische Markersysteme 29 3.1.1 Allozyme 29 3.1.2 Mikrosatelliten 30 3.1.3 mtDNA Sequenzierung 31 3.1.4 Sequenzierung nukle?rer DANN 32 3.1.5 DNA-Fingerprinting-Techniken: RAPDs, AFLPs und verwandte Marker 33 3.1.6 Single Nucleotid Polymorphisms (SNPs) 35 3.2 Statistische Methoden der Auswertung molekularer Datens?tze 35 3.2.1 Genetische Diversit?ten und genetische Distanzen 35 3.2.2 F-Statistik 37 3.2.3 Haplotypennetzwerke 40 3.2.4 Mismatch Distributions und Tajima's D 42 3.2.5 Clusteranalysen 43 3.2.6 STRUCTURE, BAPS und GENELAND 45 3.2.7 Molekulare Uhren 45 4 Ausbreitung: Prozesse und Muster 49 5 Westliche Pal?arktis 55 5.1 Mediterrane Arten 55 5.1.1 Die mediterranen Refugialr?ume 55 5.1.2 Postglaziale Arealexpansionen aus mediterranen Refugialr?umen: Die vier Paradigmen 79 5.1.3 Ausbildung von Kontaktzonen in Europa 81 5.1.4 Die makrogenetische Struktur Europas f?r Arten mit mediterranen Ausbreitungszentren 84 5.1.5 Zusammenfassung mediterrane Arten 84 5.2 Kontinentale Arten 85 5.2.1 Extramediterrane Arealkerne und ihre Arealdynamiken 86 5.2.2 Kombination extramediterraner und mediterraner Arealkerne 98 5.2.3 Was macht extramediterrane Glazialrefugien so wichtig und so besonders? 105 5.2.4 Zusammenfassung kontinentale Arten 107 5.3 Gebirgsarten und Arten des Hohen Nordens 108 5.3.1 Genetische Strukturen innerhalb von Gebirgen 109 5.3.2 Biogeographische Verbindungen zwischen Gebirgssystemen 123 5.3.3 Arkto-alpine Arten 131 5.3.4 Boreo-montane und montan disjunkte Arten 136 5.3.5 Oro-mediterrane Arten 143 5.3.6 Zusammenfassung Gebirgsarten und Arten des Hohen Nordens 144 5.4 Arten der gro?en Flie?gew?sser Europas 145 5.4.1 Phylogeographie europ?ischer Fischarten 145 5.4.2 Zusammenfassung Arten der gro?en Flie?gew?sser 157 5.5 Zusammenfassung westliche Pal?arktis 157 6 Eurasien 159 6.1 Der Taigag?rtel Eurasiens 159 6.2 Biogeographische Verbindungen zwischen Ostasien und Nordamerika 169 6.3 Phylogeographie Ostasiens 172 6.3.1 Ost- und S?dchina 172 6.3.2 Tibet und die hohen Plateaus 180 6.3.3 Der trockene Westen Chinas 183 6.3.4 Japan 185 6.3.5 Taiwan 188 6.4 Phylogeographie S?dostasiens 190 6.4.1 Indien 195 6.4.2 Indochina 198 6.4.3 Sundaland 200 6.4.4 Philippinen 206 6.4.5 Wallacea 214 6.5 Zusammenfassung Eurasien 217 7 Nordamerika 221 7.1 Der S?dosten Nordamerikas 221 7.1.1 Beispiel Rattenschlange 222 7.1.2 Beispiel Klappschildkr?te 224 7.1.3 Biogeographische Paradigmen im s?d?stlichen Nordamerika 225 7.1.4 Refugien weiter n?rdlich in den ?stlichen USA 229 7.1.5 Biogeographie der K?stenbewohner des s?d?stlichen Nordamerikas 229 7.1.6 Mikrorefugien in den s?d?stlichen USA 232 7.2 Der Westen Nordamerikas 236 7.2.1 Von Norden und S?den: Die Bedeutung des Beringischen Refugiums f?r an K?lte angepasste Arten 236 7.2.2 Differenzierung in Beringien 238 7.2.3 Some like it cool: Kryptische Refugien im Nordwesten Nordamerikas 240 7.2.4 Refugien-in-Refugien: der Nordwesten der USA 244 7.2.5 Postglaziale Kolonisationsrouten im pazifischen Nordwesten Nordamerikas 248 7.2.6 Phylogeographische Ringe um das zentrale Tal Kaliforniens 249 7.2.7 S?dliche Regression, n?rdliche Expansion: R?ckzugsgebiete im S?dwesten Nordamerikas 253 7.2.8 Die W?sten Nordamerikas 257 7.2.9 Phylogeographischer Ring um das Gro?e Becken: die Ponderosa-Kiefer 262 7.3 Zusammenfassung Nordamerika 265 8 Subsahara-Afrika 267...